Apele bazinelor acvatice ale Republicii Moldova sunt folosite de populație pentru alimentarea cu apă, recreere și irigare, în dependență de calitatea acesteia. În prezent, în Republica Moldova pentru alimentarea cu apă potabilă se exploatează 3 prize de apă cu stații de tratare pe râul Nistru și 5 pe râul Prut și se află în gestiunea Î.M.”Apă Canal” teritoriale. Aceste prize de apă sunt amplasate pe toate porțiunile râurilor Nistru și Prut în perimetrul Republicii Moldova și alimentează peste 30% din populația țării cu apă potabilă.
Agenția Națională pentru Sănătate Publică (ANSP), în temeiul actelor normative în vigoare (Legii 10 din 03.02.2009, Legii apelor nr.272 din 23.12.2011, Hotărîrii Guvernului nr. 890 pentru aprobarea Regulamentului cu privire la cerințele de calitate ale mediului pentru apele de suprafață, Hotărîrea Guvernului nr. 1090 din 18.12.2017 cu privire la organizarea și funcționarea Agenției Naționale pentru Sănătate Publică) efectuează supravegherea calităţii apei de suprafaţă în 162 puncte fixe, inclusiv în 27 de puncte pe râurile Nistru şi Prut. Monitorizarea se efectuează la 36 parametri chimici şi 5 microbiologici, inclusiv la parametrii virusologici şi conţinutul de ouă viabile de helminţi.
Conform rezultatelor investigaţiilor de laborator ale calităţii apei din sursele acvatice de suprafaţă organizate în laboratoarele ANSP și Direcţiile CSP teritoriale ale ANSP, în comparaţie cu anul 2018, la parametrii sanitaro-chimici şi microbiologici se denotă o scădere a numărului de rezultate atribuite la clasa I (foarte bună) de calitate a apei şi o creştere considerabilă a numărului de rezultate atribuite la clasa IV (poluată) şi clasa V (foarte poluată). Pentru r. Nistru, ponderea probelor la parametrii sanitaro-chimici atribuite la clasa I (foarte bună) de calitate pentru a.2019 constituie 7% comparativ cu 23% în 2018.
La parametrii bacteriologici ponderea probelor atribuite la clasa IV (poluată) de calitate pentru r. Nistru a crescut de la 4% — 2018, la 15% — 2019 și pentru clasa V (foarte poluată) de la 16% — 2018, la 32% — 2019.
Înrăutățirea calității apei din bazinele acvatice la parametrii sanitaro-chimici și preponderent microbiologici pot plasa aceste fluvii în categoria IV- poluată și a V-ea –foarte poluată, iar utilizarea lor pentru alimentarea cu apă, recreere și irigare poate constitui o problemă de sănătate publică.
Cauzele principale de poluare a acestor fluvii sunt: apele reziduale neepurate sau parțial epurate din localitățile rurale și urbane deversate în afluenții râurilor Nistru și Prut, apele meteorice neepurate, salubrizarea necorespunzătoare a teritoriilor localităților, nerespectarea zonelor de protecție sanitară a bazinelor acvatice, amplasarea obiectivelor poluante în zona de protecție sanitară a bazinelor acvatice.
Pentru îmbunătățirea calității apelor de suprafață persoanelor fizice/juridice, Administrației Publice Locale, în zona de protecție sanitară a bazinelor acvatice se recomandă de prevăzut măsuri pentru: